MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 7885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	TAC	2	6	59	64	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004757	TGTT	2	8	135	142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004757	TCC	2	6	145	150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_004757	A	7	7	1602	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004757	TA	3	6	1715	1720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004757	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004757	TAT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004757	TTAA	2	8	1783	1790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004757	GA	4	8	2942	2949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004757	G	6	6	5401	5406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004757	AT	3	6	5864	5869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004757	ATT	2	6	6679	6684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004757	ATT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004757	TCC	2	6	6863	6868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_004757	CGG	2	6	6940	6945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004757	GTG	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004757	GCA	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004757	ACA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004757	GCG	2	6	7244	7249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004757	AC	4	8	7261	7268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004757	GT	3	6	7274	7279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004757	TTTC	2	8	7315	7322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004757	ATC	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004757	A	6	6	14687	14692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004757	CTG	2	6	14742	14747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004757	TTGA	2	8	15384	15391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004757	ATT	2	6	15395	15400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004757	GCAGC	2	10	15441	15450	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004757	GTT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004757	A	6	6	18048	18053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004757	CAA	2	6	20155	20160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004757	C	6	6	22753	22758	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_004757	CAA	3	9	22761	22769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004757	GCC	2	6	22784	22789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_004757	TCTT	2	8	22817	22824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004757	CGTTG	2	10	22858	22867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004757	A	6	6	26812	26817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004757	ATT	2	6	26849	26854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004757	CTA	2	6	28397	28402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004757	TCA	2	6	28617	28622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004757	AGG	2	6	28640	28645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004757	CAA	2	6	29181	29186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004757	GCA	2	6	29202	29207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004757	ATG	2	6	31278	31283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004757	AGA	2	6	31668	31673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004757	CTG	2	6	31706	31711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004757	TAT	2	6	34472	34477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004757	TAA	2	6	34501	34506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004757	TCTG	2	8	34507	34514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_004757	ACT	2	6	34542	34547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004757	A	6	6	34553	34558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004757	TTG	2	6	34900	34905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004757	AAT	2	6	34906	34911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004757	CGGT	2	8	36590	36597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004757	T	6	6	36663	36668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004757	CAGG	2	8	37458	37465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_004757	AAT	2	6	37564	37569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004757	C	6	6	37693	37698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_004757	AAT	2	6	39761	39766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004757	TTCG	2	8	39775	39782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004757	TTG	2	6	41094	41099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004757	T	6	6	41108	41113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004757	TCG	2	6	41158	41163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004757	GGT	2	6	43816	43821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004757	TTTTG	2	10	43823	43832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004757	ATG	2	6	43844	43849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004757	TGA	2	6	43861	43866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004757	TAA	2	6	43890	43895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004757	ATA	2	6	43935	43940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004757	T	6	6	43941	43946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004757	TTA	2	6	43956	43961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004757	AGC	2	6	45214	45219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004757	TTC	2	6	45224	45229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004757	A	6	6	45236	45241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004757	GAG	2	6	45243	45248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004757	TGC	2	6	45252	45257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004757	T	6	6	45325	45330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004757	TTG	2	6	45376	45381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004757	GCT	2	6	45392	45397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004757	GCC	2	6	45410	45415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004757	TTTC	2	8	45454	45461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004757	GCT	2	6	47950	47955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004757	ATG	2	6	47956	47961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004757	ATT	2	6	50093	50098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004757	GA	3	6	50166	50171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004757	CGC	2	6	50197	50202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_004757	GAG	2	6	50247	50252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004757	AAAC	2	8	53505	53512	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004757	T	6	6	54058	54063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004757	GTT	2	6	54757	54762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004757	CAA	2	6	54789	54794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004757	TTC	2	6	54833	54838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004757	GCT	2	6	58900	58905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004757	CCTG	2	8	58931	58938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004757	AGT	2	6	59040	59045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004757	TTG	2	6	59706	59711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004757	CAC	2	6	59808	59813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_004757	CTG	2	6	59817	59822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_004757	TTGC	2	8	59858	59865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004757	ACA	2	6	68348	68353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004757	AAT	2	6	68442	68447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004757	TTG	2	6	68487	68492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004757	GCA	2	6	68504	68509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004757	CGGCA	2	10	68588	68597	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_004757	TGAG	2	8	68721	68728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004757	ACG	2	6	68741	68746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004757	ATA	2	6	68796	68801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004757	TAC	2	6	68808	68813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004757	GAT	2	6	68864	68869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004757	AT	3	6	68868	68873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004757	AAT	2	6	68884	68889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004757	A	6	6	68914	68919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004757	TA	3	6	68955	68960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004757	AC	3	6	68982	68987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_004757	CAAAG	2	10	68992	69001	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004757	A	6	6	69075	69080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004757	ATT	2	6	69096	69101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004757	GGC	2	6	69176	69181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004757	GAG	2	6	69319	69324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004757	TGG	2	6	69384	69389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004757	AGT	2	6	69416	69421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004757	GCA	2	6	69482	69487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004757	GTGA	2	8	69535	69542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004757	GAAA	2	8	69577	69584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004757	AAT	2	6	69596	69601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004757	CAG	2	6	69650	69655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004757	GCA	2	6	69789	69794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004757	GAA	2	6	69842	69847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004757	TACC	2	8	70114	70121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_004757	TGC	2	6	70183	70188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004757	GTC	2	6	70195	70200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004757	TCGTG	2	10	70204	70213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004757	GGA	2	6	70308	70313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004757	CGT	2	6	70427	70432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004757	AC	3	6	70528	70533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004757	AGG	2	6	70587	70592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004757	CCT	2	6	70669	70674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_004757	ATT	2	6	70682	70687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004757	GTT	2	6	70709	70714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004757	GGT	2	6	70821	70826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004757	CAC	2	6	70844	70849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_004757	CCA	2	6	70922	70927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_004757	A	6	6	70946	70951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004757	A	6	6	70974	70979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004757	AATCTA	2	12	71014	71025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_004757	TGA	2	6	71032	71037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_004757	GAG	2	6	160537	160542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
423	NC_004757	GAT	2	6	160599	160604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_004757	GCA	2	6	162557	162562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_004757	TAC	2	6	166834	166839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_004757	CAG	2	6	168305	168310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_004757	CGT	2	6	168377	168382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_004757	GGT	2	6	168486	168491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_004757	GCGA	2	8	168627	168634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
463	NC_004757	TAG	2	6	168668	168673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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